Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COX6A1P12074 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms