Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FAM228BP0C875 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FAM228BP0C875 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms