Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTMAP06454 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTMAP06454 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTMAP06454 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTMAP06454 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTMAP06454 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTMAP06454 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTMAP06454 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms