Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC28A2O43868 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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