Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

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Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNA1GO43497 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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