Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRRTM2O43300 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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