Protein–RNA interactions for Protein: O15533

TAPBP, Tapasin, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBPO15533 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TAPBPO15533 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TAPBPO15533 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TAPBPO15533 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TAPBPO15533 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TAPBPO15533 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TAPBPO15533 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAPBPO15533 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAPBPO15533 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAPBPO15533 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAPBPO15533 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAPBPO15533 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAPBPO15533 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAPBPO15533 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAPBPO15533 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAPBPO15533 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAPBPO15533 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TAPBPO15533 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAPBPO15533 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TAPBPO15533 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms