Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms