Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
C9orf92A6NGG3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
C9orf92A6NGG3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms