Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC162PA2VCL2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC162PA2VCL2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms