Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP1Q9UPQ3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms