Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms