Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNRF3Q9ULT6 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms