Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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RABGEF1Q9UJ41 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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RABGEF1Q9UJ41 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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RABGEF1Q9UJ41 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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RABGEF1Q9UJ41 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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RABGEF1Q9UJ41 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RABGEF1Q9UJ41 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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