Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHF11Q9UIL8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms