Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms