Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IFT172Q9UG01 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms