Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTSFQ9UBX1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms