Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAPAQ9P0L0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms