Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms