Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms