Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRT84Q9NSB2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms