Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NECTIN3Q9NQS3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms