Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MEPEQ9NQ76 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms