Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMMDC1Q9NPL8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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