Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C11orf49Q9H6J7 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms