Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZYG11BQ9C0D3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms