Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CIPCQ9C0C6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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