Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SMIM3Q9BZL3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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