Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms