Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRRC1Q96M27 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms