Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC97Q96F63 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCDC97Q96F63 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms