Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMIGD2Q96BF3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms