Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXB13Q92826 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms