Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms