Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF439Q8NDP4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms