Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms