Protein–RNA interactions for Protein: Q8N816

TMEM99, Transmembrane protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM99Q8N816 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM99Q8N816 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM99Q8N816 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms