Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms