Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HECW1Q76N89 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HECW1Q76N89 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms