Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMBR1LQ6UX01 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMBR1LQ6UX01 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms