Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SUSD1Q6UWL2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms