Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
C16orf54Q6UWD8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms