Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
DUX4L9Q6RFH8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms