Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC174Q6PII3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms