Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG9BQ674R7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG9BQ674R7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms