Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
WSCD1Q658N2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
WSCD1Q658N2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms