Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC92Q53HC0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms