Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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GEN1Q17RS7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
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GEN1Q17RS7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GEN1Q17RS7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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