Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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RTL8BQ17RB0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RTL8BQ17RB0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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